Intérêt des puces de génotypage

Intérêt des puces de génotypage

L'approche de cartographie par recherche d’homozygotie (voir article dédié) a été rendue particulièrement aisée grâce à l’émergence de nouveaux outils de génotypage à grande échelle : les puces à SNP, qui permettent de génotyper simultanément 54 000 positions sur le génome, voire 777 000 avec la puce à très haut débit.

Cette étape de localisation génétique (ou cartographie génétique) est possible grâce au génotypage de quelques cas et d’individus non atteints (contrôles). Une fois la région identifiée, la puce est également utilisable pour mettre au point un test sur haplotype permettant un diagnostic indirect et une utilisation à grande échelle, avant l'identification de la mutation causale, dont le test sera plus fiable et moins coûteux.

la ou les mutations candidates peuvent ensuite être déposées également sur la puce, dans une partie privative dédiée à la recherche, afin de vérifier la concordance des statuts des animaux à grande échelle.

Date de modification : 24 octobre 2023 | Date de création : 23 janvier 2012 | Rédaction : ONAB